用人公司微信转账发工资的处理，可能受特殊情况或例外情形影响，以下为您说明：
1、双方协商一致变更支付方式：若劳动合同原约定非微信转账，但用人单位与员工协商一致（书面或口头）变更，且实际履行无异议，微信转账发工资合法，不影响支付有效性。
2、微信转账记录被删除或无法恢复：若员工因手机故障、误删等导致转账记录无法恢复，且公司未提供其他工资支付凭证，员工主张工资权益时会因缺乏关键证据处于不利地位，劳动争议处理困难，影响权益维护。
3、涉及农民工等特殊群体工资支付：建筑领域农民工等特殊群体，根据相关规定，用人单位应实行实名制管理，通过银行转账支付工资至本人账户。若用人公司对农民工采用微信转账，可能不符合特殊群体工资支付专项规定，被认定为违法支付，面临处罚。
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用人公司微信转账发工资是否违法，需结合具体情况判断：
若劳动合同明确约定工资支付方式为微信转账，且公司能提供合法工资支付凭证（如工资条）并及时足额支付，微信转账本身不违法。若劳动合同约定非微信转账，公司未与员工协商一致擅自变更，可能涉嫌违反劳动合同约定。若公司为逃避税收、社保缴费等法定义务而微信转账发工资，该行为违法。
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针对用人公司微信转账发工资是否违法的问题，可依据相关法律规定分析：
《中华人民共和国劳动合同法》（2012年修正）第三十条规定：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。”该法条强调用人单位需按约定和国家规定及时足额支付劳动报酬，并未绝对禁止微信转账。因此，用人公司微信转账发工资，只要符合劳动合同约定且及时足额支付，即不违反此条法律规定；反之，若未按约定或未及时足额支付，即便使用微信转账，也属违法行为。
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面对用人公司微信转账发工资的情形，需注意避免以下错误操作，以免影响自身权益：
1、忽视劳动合同约定：不查看劳动合同中工资支付方式条款，默认微信转账合法，可能在公司擅自变更支付方式时无法及时察觉权益受损。
2、不重视证据保存：未妥善保存微信转账记录、聊天记录等工资支付相关证据，劳动争议发生时可能因缺乏证据难以维权。
3、发现问题后不及时沟通：意识到微信转账发工资存在问题（如未收到工资条、社保缴纳异常等）时，未及时与公司沟通核实，拖延可能导致问题积累，增加后续维权难度。若已出现上述错误操作，或对公司微信转账发工资行为有疑问，您可以咨询我，我会为您提供解答。

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